中山杉的耐澇特性遺傳了其親本落羽杉的特征，落羽杉耐澇機理的研究重點涉及生理、形態(tài)解剖及生長情況等方面。生理方面，主要探討了水淹以后氣孔導(dǎo)性、呼吸速率、凈光合速率等產(chǎn)生的變化。形態(tài)解剖上的適應(yīng)性主要表現(xiàn)為水面以下部分樹干的管胞變得較寬，細胞壁變薄，樹皮變薄，樹干基部膨大，樹干上有氣生根分布，近地表有一輪根系分布，直根不明顯，水平根發(fā)達；落羽杉在淹水以后的生長量并沒有顯著減少，而且間歇性淹水，對其生長還有一定的促進作用。

中山杉能夠耐澇害，以種植在南京八卦洲的中山杉和水杉為例，1990年代發(fā)生澇害時，中山杉在淹水深度為100cm左右的情況下浸泡15～20d，水退后觀察，植株沒有受到任何影響；然而同樣條件的水杉葉子枯黃、而且爛根， 枯死。中山植物園進行雜交系列新品種水培法耐鹽實驗，對照組118、102、149等8個品種水培法連續(xù)浸泡120d后，不僅沒有出現(xiàn)死亡，而且生長正常。